initWithNibName:bundleメソッドのbunleは、何も考えずにnilを入れていました。よくよく考えると、Bundleファイルが指定できるのですね。

Bundleファイルがルートディレクトリにある場合、

NSBundle *bundle = [NSBundle bundleWithPath:[[NSBundle mainBundle] pathForResource:@"hogehoge" ofType:@"bundle"]];

のような感じで指定できます。